Инстититуција позната под скраћеним називом „Пловпут“ основана је 1962. године, а са радом је почела 1963. године

Установа за одржавање унутрашњих пловних путева основана је Уредбом Савезног извршног већа ФНРЈ 14. новембра 1962. године, а са радом је почела 1963. године, као наследник Секције за пловне путеве из времена Краљевине Југославије.


Архива Пловпута: пловило Пловпута СПП ВИИ (Назив СПП означава некадашњу Секцију за пловне путеве)

Посебан Закон о Установи за одржавање унутрашњих пловних путева усвојен је 11. октобра 1974. године. Институција 1997. године мења назив у Савезна јавна установа за одржавање и развој унутрашњих пловних путева (Службени лист СРЈ, број 11). У априлу 2003. године, у складу са Одлуком о прихватању споразума држава чланица о дефинисању коначног статуса органа и организација из члана 15. Закона за спровођење Уставне повеље Државне заједнице Србија и Црна Гора, Пловпут постаје орган државе чланице Србије (Службени гласних Републике Србије, број 35, 02. април 2003. године).

Архива Пловпута: Исечак из Службеног листа ФНРЈ, среда, 14. новембар 1962. Године, део Уредбе о Установи за одржавање унутрашних пловних путева

Законом о министарствима (2007) институција мења назив и постаје Дирекција за унутрашње пловне путеве „Пловпут“. Усвајањем Закона о пловидби и лукама на унутрашњим водама (Службени гласник Републике Србије, број 73/10), институција је дефинисана под називом Дирекција за водне путеве. Од 01. јануара 2013. године, у складу са усвојеним Изменама и допунама Закона о пловидби и лукама на унутрашњим водама, Дирекција за водне путеве је постала орган управе у саставу Министарства саобраћаја. Ове године Дирекција за водне путеве слави 50 година рада.